《条例》规定，加快产业发展方面，省政府有关部门应当按照各自职责推进海域资源市场化配置，完善海域使用权招拍挂制度，依法建立海域资源确权登记制度。 县级以上政府应当加快沿海、近海、远海、深海各类产业发展，推动跨区域协同发展，打造高质量沿海经济带。
加强港口建设方面， 《条例》规定，应当加大港口设施投资力度，完善港口集疏运体系，加强跨区域港口协作，科学布局临港产业项目，大力发展临港经济，提升港口资源综合利用效益，推动港产城融合发展。
发展海洋渔业方面 ， 《条例》规定，要保障水产品安全有效供给，加强渔业生产服务，打造“福海粮仓”;应当合理控制近海捕捞强度，建立重要养殖水域滩涂保护制度，积极推进海洋牧场建设，发展深远海装备养殖。
强化海洋生态保护方面， 《条例》明确应当严格管控新增无居民海岛开发利用，依法促进海岛自然资源合理利用;落实海洋生态保护补偿金，制定科学合理的差异化利益补偿标准;严格落实海域排污许可管理，加大入河、入海排污口的监管力度，加强监测和监管放射性物质对海洋环境的影响。
《条例》还设置专章深化闽台融合发展， 规定建立闽台海洋经济融合发展协同落实机制，推进闽台海域基础设施联通、海洋产业合作、科技协同创新，加强闽台海洋资源开发、海洋环境协同保护、海洋综合管理、海洋文化等领域交流合作。
